Der Name Sargassosee ist von den großen Mengen der frei im Wasser schwebenden Braunalgen der Gattung Sargassum abgeleitet. Die Seitenarme dieser Pflanzen können bis zu 300 Meter lang werden. Die Primärproduktion ist erheblich, es wird geschätzt, dass ein Drittel der Primärproduktion des offenen Atlantiks in der Sargassosee stattfindet.Wissenschaftler vermuten, dass die Sargassum-Braunalgen sehr alt werden können, so dass heutige Pflanzen schon durch ihren Entdecker Christoph Kolumbus gesehen wurden.