The smaller the agent, the more difficult it is to destroy it. Prions are quite resistant to proteases, heat, radiation, and formalin treatments. 134°C (274°F) for 18 minutes in a pressurized steam autoclave may not be enough to deactivate the agent of disease. Prions may last for decades in the environment.

Im czynnik jest mniejszy i prostszy, tym trudniej go unieszkodliwić. Priony są odporne na wysoką temperaturę, promieniowanie i wiele czynników chemicznych. Są w stanie przetrwać osiemnastominutową sterylizację w autoklawie przy 134°C. Nie degradują sie też szybko, mogąc przetrwać dziesięciolecia.