Samica pingwina cesarskiego składa jedno jajo o masie 460–470 g w maju lub na początku czerwca. Ma nieco gruszkowaty kształt, bladozielono-biały kolor i wymiary około 12 na 8 cm. o złożeniu jaja rezerwy pokarmowe matki są wyczerpane. Bardzo ostrożnie przenosi jajo do samca, a następnie natychmiast wraca na morze na dwa miesiące, aby się pożywić.