Makarios III łączył działalność religijną z narodową. Z jego inicjatywy odbywały się manifestacje Greków cypryjskich, domagających się niepodległości wyspy. Ostatecznie w 1960 r. Cypr uzyskał niepodległość od Wielkiej Brytanii, a Makarios III został przez Greków cypryjskich wybrany na pierwszego prezydenta. Do końca życia działał na rzecz likwidacji skutków inwazji tureckiej na Cypr dokonanej w 1974 r.